На этот вопрос дал ответ Минтруд в Письме от 25.03.2020 № 14-2/В-308.
Порядок внесения такой записи зависит от того, каким образом был оформлен переход работника из совместителя в основной состав.
Первый способ: трудовой договор по основному месту работы расторгается, а в трудовую книжку вносится соответствующая запись. В трудовой договор, заключенный на работе по совместительству, вносятся изменения (путем заключения дополнительного соглашения) о том, что работа является основной, об изменении режима работы и, при необходимости, другие условия.
Второй способ: трудовой договор на работе по совместительству расторгается на основании заявления работника об увольнении по собственному желанию по п. 3 ч. 1 ст. 77 ТК РФ или по соглашению сторон по п. 1 ч. 1 ст. 77, а затем заключается новый трудовой договор. В первом случае это кадровое мероприятие оформляется в виде перевода с работы по совместительству на основную работу у конкретного работодателя.
Во втором отражается увольнение с работы по совместительству и прием на основную работу у конкретного работодателя.